Né à Liège en 1968, Éric Mairlot étudie aux Conservatoires royaux de Bruxelles et Liège dans les classes d'Hubert Schoonbroodt et d'Anne Froidebise. Il y obtient plusieurs Premiers Prix ainsi qu'un Diplôme Supérieur d'orgue. Il reçoit ensuite les conseils de Jean Boyer, Jan Willem Jansen, Louis Robilliard et Maurice Clerc, avant de compléter sa formation à Paris avec Pierre Cogen. Éric Mairlot a joué à New York (St. Thomas Church), à San Francisco (St. Mary Cathedral), à Paris (La Madeleine, Saint-Étienne-du-Mont, Notre-Dame d'Auteuil) et dans divers festivals,
notamment à Saint-Bertrand-de-Comminges, Liège, Spa, Châtelet… Il s'est produit à plusieurs reprises en France, notamment à Bordeaux, Guîtres, Périgueux, Saint-Sever et au Havre. Licencié en musicologie de l'Université Libre de Bruxelles, il a collaboré de 1993 à 1995 à l'inventaire des Orgues de Wallonie, recensant plus de 300 orgues en province de Liège. De 1996 à 1999, il a travaillé à la Section de la Musique de la Bibliothèque royale Albert Ier de Bruxelles pour un projet international de catalogage de manuscrits musicaux. Depuis septembre 2000, il est rédacteur des programmes de l'Orchestre Philharmonique de Liège Wallonie-Bruxelles. En 2007, il joue notamment à Notre-Dame de Paris, à l'Hôpital Saint-Jean de Furnes, à la basilique de Tongres et à la cathédrale d'Anvers.